长期从事工业生物催化、合成生物学、微生物代谢工程及生物纳米技术研究。重点开展微生物全细胞催化剂及高性能细胞工厂构建的科学基础与新方法研究及产业化生产实践，致力于发展高效、通用的工业微生物底盘细胞，构建细胞工厂和细胞催化剂的定制化、模块化组装平台，实现智慧型绿色生物制造。在高抗逆性红球菌微生物细胞催化剂平台创制及其高效催化合成酰胺、羧酸和手性医药中间体、酶分子设计与改造、重组枯草芽孢杆菌细胞工厂高效合成脂肽、重组谷氨酸棒杆菌细胞工厂高效合成透明质酸以及基于M13噬菌体生物模板的生物纳米技术研究等方面取得主要进展。在Metabolic Engineering，ACS Synthetic Biology, Biomacromolecules, New Biotechnology, Applied Microbiology and Biotechnology等期刊发表SCI收录论文近90篇，撰写中英文专著章节5篇，申请/授权发明专利40多项。2017年获教育部技术发明二等奖（第一完成人），2016年获东营市科学技术合作奖，2013年获中国石油和化学工业联合会技术发明二等奖（第一完成人），2003年获教育部自然科学二等奖（第二完成人）。2008年获教育部新世纪优秀人才称号，2007年获评北京市科技新星（A类），2005年获评清华大学华新杰出学者，2003年获得全国优秀博士论文奖。

●  教育与工作经历

1991-1996   清华大学化学工程系，学士

1996-2001   清华大学化学工程系，博士

2000-2003   清华大学化学工程系，讲师

2005-2006   美国麻省理工学院化学工程系，访问学者

2003-2012   清华大学化学工程系，副教授

2011-2016   清华大学(化工系)-山东宝莫股份 生物化学品联合研究中心 主任

2012-2016   清华大学化学工程系，教授、博士生导师

2016-至今   清华大学化工系 教学科研系列 长聘教授 博士生导师

●  研究领域

工业生物催化、合成生物学、微生物代谢工程、生物纳米技术。

●  开设课程及编写教材

开设课程：本科生课程《生物化学原理》 ；研究生课程《分子酶工程》

参编教材：《生物炼制技术》，谭天伟，秦培勇 主编，2020；《生物反应工程原理》，曹竹安，陈坚 主编，2011

●  主要学术任职

2020年~至今，中国生化制药工业协会糖类药物分会，专家委员会 专家

2020年~至今，欧洲生物技术协会，会员

2020年~至今， Biochemical Engineering Journal，编委

2019年~至今，亚洲合成生物学联盟，会员

2019年~至今，Biotechnology Notes 副主编

2015年~至今，《化学与生物工程》，编委

●  代表性论文/专利/著作

1．Miaomiao Wang, Huimin Yu*, Xu Li, Zhongyao Shen. Single-gene regulated non-spore-forming Bacillus subtilis: different patterns, transcriptome responses and applications for producing enzymes and surfactin. Metabolic Engineering, 2020. 62：235-248.

2．Youxiang Liang, Song Jiao, Miaomiao Wang, Huimin Yu* and Zhongyao Shen. A CRISPR/Cas9-based genome editing system for Rhodococcus ruber TH. Metabolic Engineering, 2020, 57: 13-22.

3．Chunmeng Xu, Lingjun Tang, Youxiang Liang, Song Jiao, Huimin Yu* and Hui Luo. Novel chaperones RrGroEL and RrGroES for activity and stability enhancement of nitrilase in Escherichia coli and Rhodococcus ruber. Molecules. 2020. 25: 1002-1016.

4．Song Jiao, Fulong Li, Huimin Yu* and Zhongyao Shen. Advances in acrylamide bioproduction catalyzed with Rhodococcus cells harboring nitrile hydratase. Applied Microbiology and Biotechnology, 2020, 104(3): 1001-1012.

5．Fangyu Cheng, HuiminYu*, Gregory Stephanopoulos*. Engineering Corynebacterium glutamicum for high-titer biosynthesis of hyaluronic acid. Metabolic Engineering, 2019, 55: 276-289.

6．Miaomiao Wang*, Huimin Yu*, Zhongyao Shen. Antisense RNA-based strategy to enhance ACCase activity and surfactin production in Bacillus subtilis TS1726. ACS Synthetic Biology, 2019, 8: 251-256.

7．Lingjun Tang, Ji Yang, Jie Chen, Jing Zhang, Huimin Yu* and Zhongyao Shen. Design of salt-bridge cyclization peptide tags for stability and activity enhancement of enzymes. Process Biochemistry 2019, 81: 39-47.

8．Youxiang Liang, Song Jiao, Miaomiao Wang, Huimin Yu* and Zhongyao Shen. Overexpression of epoxide hydrolase in Rhodococcus ruber with high robustness for the synthesis of chiral epichlorohydrin. Process Biochemistry. 2019, 79: 49-56.

9．Song Jiao, Huimin Yu* and Zhongyao Shen. Core elements characterization of Rhodococcus promoters and development of a gradient intensity mini-pool for efficient gene expression. New Biotechnology, 2018, 44: 41-49.

10．Miaomiao Wang*, Jie Chen, Huimin Yu*, Zhongyao Shen. Improving stress tolerance and cell integrity of Rhodococcus ruber by overexpressing small-shock-protein Hsp16 of Rhodococcus. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, 2018, 45: 929–938.

11．Yangzi Chen, Song Jiao, Miaomiao Wang, Jie Chen, Huimin Yu*. A novel molecular chaperone GroEL2 from Rhodococcus ruber and its fusion chimera with nitrile hydratase for co-enhanced activity and stability. Chemical Engineering Science, 2018, 192: 235–243.

12．Fangyu Cheng, Sijin Luozhong, Zhigang Guo, Huimin Yu* and Gregory Stephanopoulos. Enhanced biosynthesis of hyaluronic acid with engineered Corynebacterium glutamicum via metabolic pathway regulation. Biotechnology Journal. 2017, 12: 1700191.

13．Ji Yang, Fangyu Cheng, Huimin Yu*, Junting Wang, Zhigang Guo and Gregory Stephanopoulos. Key role of the carboxyl terminus of hyaluronan synthase in processive synthesis and size control of hyaluronic acid polymers. Biomacromolecules, 2017, 18: 1064−1073.

14．Song Jiao, Jie Chen, Huimin Yu*, Zhongyao Shen. Tuning and elucidation of the colony dimorphism in Rhodococcus ruber associated with cell flocculation in large scale fermentation. Appl Microbiol Biotechnol., 2017, 101: 6321-6332.

15．Song Jiao, Xu Li, Huimin Yu*, Huan Yang, Xue Li and Zhongyao Shen. In situ enhancement of surfactin biosynthesis in Bacillus subtilis using novel artificial inducible promoters. Biotechnology and Bioengineering 2017, 114(4): 832–842.

16．Shuai Zhang, Huimin Yu*, Ji Yang, Zhongyao Shen. Design of the nanoarray-pattern Fe-Ni bi-metal nanoparticles@M13 virus for enhanced reduction of p-chloronitrobenzene through micro-electrolysis effect. Environmental Science: Nano, 2017, 4: 876 - 885.

17．Jizhe Sun, Huimin Yu*, Jie Chen, Hui Luo and Zhongyao Shen. Ammonium acrylate biomanufacturing by an engineered Rhodococcus ruber with nitrilase overexpression and double-knockout of nitrile hydratase and amidase. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology. 2016, 43(12):1631-1639.

18．Huan Yang, Xu Li, Xue Li, Huimin Yu* and Zhongyao Shen. Identification of lipopeptide isoforms by tandem MALDI-TOF-MS/MS based on the simultaneous purification of iturin, fengycin and surfactin by RP-HPLC. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 2015, 407(9): 2529-2542.

19．Xu Li, Huan Yang, Donglai Zhang, Xue Li, Huimin Yu* & Zhongyao Shen. Overexpression of specific proton motive force-dependent transporters facilitate the export of surfactin in Bacillus subtilis. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology: 2015, 42(1) : 93-103.

20．Jie Chen, Huimin Yu*, Changchun Liu, Jie Liu and Zhongyao Shen. Improving stability of nitrile hydratase by bridging the salt-bridges in specific thermal-sensitive regions. Journal of Biotechnology, 2013, 164: 354–362.

●  学术荣誉与奖励

2017，高等学校科学研究优秀成果奖  技术发明奖  二等奖（第1完成人），教育部

2016，东营市科学技术合作奖，东营市科技局

2013, 技术发明二等奖（第1完成人），中国石油和化学工业联合会

2010, 青年科技突出贡献奖，中国石油和化学工业联合会

2008, 新世纪优秀人才，教育部

2007, 北京市科技新星（A类)，北京市科学技术委员会

2005, 华新杰出学者，清华大学

2003, 全国百篇优秀博士学位论文奖，国务院和教育部

2003, 教育部提名国家科学技术奖自然科学奖二等奖（第2完成人）

●  实验室主页

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